南农大完成植物重复基因数据库

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近日，记者从南京农业大学了解到，张少玲教授的团队系统地鉴定了梨等141种植物基因组中不同类型的重复基因，并构建了植物重复基因数据库，揭示了重复基因进化的一般规律。相关成果最近已在国际知名学术期刊《基因组生物学》上发表，该数据库也已在南方农业大学官方网站上被国内外研究人员共享。

该论文的第一作者、南京农业大学园艺学院博士生乔欣认为，重复基因是由基因复制产生的两个同源基因。通过复制基因，植物可以丰富自己的基因库，抵御复杂多变的外部环境，增加进化和变异的机会，实现物种分化和多样性。

随着近年来测序技术的升级，测序成本大大降低，越来越多的植物基因组被破译。目前，已对200多种植物进行了测序，包括单细胞绿藻、苔藓、蕨类、裸子植物和被子植物。然而，仍然缺乏一种通用的方法来鉴定不同种类植物的重复基因。

南方农业大学张少玲教授的团队之前已经系统地鉴定了梨基因组中的重复基因。基于此，该团队开发了一种具有普遍适用性的生物信息学方法，并深入分析了141种植物的基因组。

结果表明，在植物进化的漫长过程中，基因串联复制和相邻复制始终保持的频率较高，为植物适应复杂多变的外部环境提供了源源不断的遗传变异材料。在基因组加倍后的短时间内，重复基因之间会发生频繁的基因替换，并且随着时间的推移会发生进一步的分化。

张少玲表示，该团队利用141种植物基因组中包含的所有蛋白质序列，构建了一个大规模的植物同源基因家族，包括大豆、水稻、小麦、玉米等大宗粮食作物，以及梨、桃、葡萄、蔬菜和花卉等园艺作物，今后植物种类将会陆续扩大。

来源：人民视窗网